Code Geass ban đầu được Ōkōchi Ichirō và Gorō Taniguchi phát triển tại Sunrise, rồi đề xuất nó lên nhà sản xuất Kawaguchi Yoshitaka. Kawaguchi trước đó đã tiếp cận Okouchi và Taniguchi trong quá trình sản xuất Planetes.[1] Ý tưởng cơ bản đối với cốt truyện gồm có một "anh hùng", người đứng đầu một tổ chức bí mật, mà sau này dần phát triển thành một cuộc xung đột giữa hai nhân vật có giá trị khác nhau và thuộc về cùng một đơn vị quân đội.[1]

Trong các giai đoạn lập kế hoạch ban đầu, Kawaguchi còn liên lạc để hội ý với nhóm mangaka CLAMP. Đây là lần đầu tiên CLAMP từng được yêu cầu việc thiết kế các nhân vật trong một bộ anime.[2] CLAMP đã ký vào dự án lúc ban đầu trong giai đoạn phát triển và cung cấp nhiều ý tưởng giúp phát triển bối cảnh và nhân vật của anime.[2]

Trong quá trình phát triển việc thiết kế nhân vật dành cho Lelouch Lamperouge, nhân vật chính của bộ anime, CLAMP lúc đầu tưởng tượng màu tóc của cậu là màu trắng. Ōkawa Ageha, trưởng nhóm kịch bản của CLAMP, cho biết cô đã hình dung về Lelouch kiểu như một nhân vật mà "tất cả mọi người "có thể kể đến như là vẻ ngoài điềm tĩnh, theo nghĩa đen là một "nét đẹp".[2] Trong giai đoạn lên kế hoạch, CLAMP và các nhân viên Sunrise đã thảo luận một số nguồn cảm hứng có thể cho các nhân vật, bao gồm cả KinKi Kids và Tackey & Tsubasa. Họ muốn tạo ra một "show lớn," một bộ anime đủ sức sức thu hút đến "tất cả mọi người".[2] Thế thân của Lelouch là Zero cũng được xem là một trong những nhân vật được phát triển sớm nhất, mà Ōkouchi muốn có một chiếc mặt nạ được coi như là một phần của bộ anime này, cảm thấy nó rất cần thiết để trở thành một Sunrise show, riêng CLAMP thì muốn một thiết kế độc đáo chưa bao giờ được nhìn thấy trước đây trong bất kỳ bộ anime nào của Sunrise (mặt nạ được đặt biệt danh là "tulip" vì thiết kế đặc biệt của nó).[2]

Nghệ thuật thiết kế nhân vật gốc hoàn chỉnh của CLAMP, do trưởng nhóm mangaka là Mokona minh họa, sau đó đã được nhà thiết kế nhân vật của Sunrise là Kimura Takahiro chuyển đổi thành các thiết kế nhân vật hoạt hình dành cho anime, ông cũng chính là người trước đó đã trải qua "mỗi ngày" để phân tích nghệ thuật và phong cách của CLAMP từ các cuốn artbook và các bộ manga của họ.[2] Trong khi làm việc trên các thiết kế nhân vật hoạt hình, ông tập trung vào việc thiết kế chúng để cho phép những họa sĩ hoạt hình khác của bộ anime áp dụng chúng mà không đi lệch khỏi phong cách nghệ thuật ban đầu của CLAMP.[2]

Âm nhạc cho bộ anime được sáng tác bởi Nakagawa Kōtarō và Kuroishi Hitomi, người trước đó đã làm việc với bộ phận chủ chốt của anime trong Planetes và tác phẩm trước đây của Taniguchi là Gun X Sword. Ngoài những đoạn nhạc ngẫu nhiên xuất hiện trong mỗi tập phim, Kuroishi cũng sáng tác rất nhiều ca khúc lồng vào trong anime, bao gồm "Stories", "Masquerade", "Alone" và "Innocent Days" đều do đích thân Kuroishi thực hiện, trong khi "Picaresque" và "Callin" được thực hiện bởi ca nhạc sĩ Sakai Mikio, cô cũng từng có thời gian trước đây làm việc với Nakagawa và Kuroishi trong Planetes. Các ban nhạc FLOW, Ali Project, Jinn, SunSet Swish, Access và Orange Range đều cung cấp những bài hát cho ca khúc mở đầu và kết thúc chủ đề.[3][4]

Khi bộ anime được phát triển để phát sóng trên Mainichi Broadcasting System, nó được đưa lên suất chiếu chính vào buổi tối thứ Bảy của hệ thống, rồi sau này được đổi thành suất chiếu vào đêm khuya thứ Năm. Do sự thay đổi này, triển vọng tổng thể và một số yếu tố của bộ anime đã thay đổi và tiếp tục phát triển để phù hợp với khán giả ở độ tuổi trưởng thành hơn vào cuối đêm.[1] Khả năng siêu nhiên "Geass" cuối cùng được đưa vào chương trình tại thời điểm này và lần đầu tiên được thai nghén như một sức mạnh đặc biệt do một "thiên thần" ban cho nhân vật chính, mặc dù phần cuối cùng này cũng đã được sửa đổi cho hợp với cốt truyện của anime.[1]